74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0806 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  100 
 
 
173 aa  363  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  65.9 
 
 
173 aa  245  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  69.93 
 
 
173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  69.18 
 
 
174 aa  220  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  53.14 
 
 
178 aa  205  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  46.67 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  33.87 
 
 
377 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  35.25 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  35.04 
 
 
363 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  35.51 
 
 
401 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  30.58 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  31.71 
 
 
252 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 
104 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  26.02 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  28.49 
 
 
388 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  26.47 
 
 
353 aa  51.2  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.85 
 
 
124 aa  50.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 
112 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  38.81 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  32.48 
 
 
423 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.1 
 
 
124 aa  48.9  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  33.05 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
278 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  30.23 
 
 
144 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  30.11 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.41 
 
 
380 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.46 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  29.23 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  23.96 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 
143 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 
122 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  30.83 
 
 
346 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  29.57 
 
 
128 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.4 
 
 
173 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 
128 aa  44.3  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.31 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 
222 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  45.1 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.13 
 
 
805 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  29.75 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  26.62 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 
220 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.33 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 
331 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  43.14 
 
 
146 aa  42  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  23.35 
 
 
167 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 
146 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 
146 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.14 
 
 
393 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.51 
 
 
170 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  28.23 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.81 
 
 
392 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  25.73 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  28.23 
 
 
123 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 
147 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 
129 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
142 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  43.14 
 
 
147 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 
113 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  22.73 
 
 
123 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 
133 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  30.23 
 
 
99 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
135 aa  40.8  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>