186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2980 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 168 aa  334  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  50 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  28.33 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.38 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  26.15 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  27.43 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  34.58 
 
 		 222 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 		 226 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.36 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  30.1 
 
 		 108 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.63 
 
 		 132 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 112 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.77 
 
 		 711 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  31.09 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  31.09 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  31.09 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  32.43 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 278 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  24.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  31.07 
 
 		 109 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  31.07 
 
 		 109 aa  50.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  31.07 
 
 		 109 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  29.13 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  31.09 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  29.13 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1261  Rhodanese domain protein  43.08 
 
 		 111 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  30.1 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  29.13 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  29.13 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.84 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  30.65 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  28.83 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  31.31 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.84 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 223 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.43 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 		 113 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 133 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  27.52 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 		 325 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  27.52 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 221 aa  47.8  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  29.32 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 		 220 aa  47.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  29.55 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  34.83 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  29.63 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  36.8 
 
 		 346 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  31.91 
 
 		 107 aa  46.6  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  30.85 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  28.97 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  27.35 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 253 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1038  rhodanese domain-containing protein  27.35 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 102 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02524  predicted inner membrane protein with hydrolase activity  27.35 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 271 aa  45.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  28.7 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02488  hypothetical protein  27.35 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2803  putative inner membrane protein  27.35 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.46 
 
 		 126 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  31.62 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 103 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  27.35 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 107 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  26.45 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  24.53 
 
 		 100 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  28.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 107 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 138 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  28.3 
 
 		 189 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 120 aa  44.3  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 123 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>