146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1355 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  100 
 
 		 161 aa  331  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.2 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.67 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  30.71 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  42.57 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  32.28 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 480 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.08 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  33.94 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  31.97 
 
 		 551 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  30.08 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  28.17 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  34.65 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.48 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.48 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  28.45 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  37.96 
 
 		 479 aa  47.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.43 
 
 		 123 aa  47.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  30.11 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 106 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 277 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  37.8 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  29.52 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  31 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  25.66 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  24.79 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 223 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.36 
 
 		 480 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  26.79 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 278 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 132 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  26.87 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  37.14 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  31.58 
 
 		 254 aa  44.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 		 237 aa  44.7  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.14 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  25.89 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  25.51 
 
 		 252 aa  44.3  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  27.52 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  30.21 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 271 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  35.79 
 
 		 711 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  28.95 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  26.09 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  30.85 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 		 353 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  30 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  32.14 
 
 		 135 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.77 
 
 		 170 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 167 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 		 167 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  24.17 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  27.1 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2558  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 331 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  29.36 
 
 		 141 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.83 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  30.91 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  30.91 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>