108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1903 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  36.27 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  35.2 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  37.84 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  28.24 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  29 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  34.34 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  25.74 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  29.46 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 		 102 aa  51.6  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  31.43 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  30.09 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  27 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.1 
 
 		 142 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  30.61 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  27.5 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  27.55 
 
 		 112 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  22.95 
 
 		 170 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  27.72 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  26.53 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 134 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  24.06 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 104 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 167 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  32.32 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 130 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 124 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  27.96 
 
 		 136 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  26 
 
 		 172 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  30.48 
 
 		 166 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  22 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  25.51 
 
 		 144 aa  45.1  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 149 aa  45.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  25.47 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  24.74 
 
 		 135 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.19 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  24.49 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  28.28 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 107 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  26 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  22.22 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  31.36 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  24.49 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  24.49 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  24.49 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2561  rhodanese domain-containing protein  27.21 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.918662  normal  0.131407 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  26.79 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  28.38 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 		 106 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  25.51 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  27.5 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  27 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  29.17 
 
 		 286 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  28.71 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  26.73 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 221 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  26.26 
 
 		 151 aa  42  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1650  rhodanese domain-containing protein  29.37 
 
 		 317 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.368491  normal  0.100041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  23.47 
 
 		 144 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>