51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1668 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  100 
 
 		 218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  64.68 
 
 		 237 aa  278  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  55.87 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  48.69 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  41.98 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  41.97 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  41.97 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  34.09 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.4 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  25.38 
 
 		 112 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.36 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  25.53 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  26.72 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  25.45 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  25.81 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  22.73 
 
 		 112 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  26.12 
 
 		 148 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  22.31 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  20.86 
 
 		 380 aa  45.1  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  26.23 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  25.98 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  28.97 
 
 		 294 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  23.08 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  60 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 141 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 124 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  31.03 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  25.66 
 
 		 124 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 221 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  23.01 
 
 		 166 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0306  rhodanese-like protein  28.45 
 
 		 293 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  24.11 
 
 		 102 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1183  rhodanese-like protein  26.55 
 
 		 286 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>