29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1028 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  100 
 
 
237 aa  491  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  62.26 
 
 
218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  58.49 
 
 
217 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  44.85 
 
 
216 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  41.98 
 
 
241 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
191 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  36.49 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 
211 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 
195 aa  99  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 
136 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.89 
 
 
247 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
162 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 
295 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5416  putative thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  33.94 
 
 
291 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
189 aa  45.1  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  22.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  23.42 
 
 
454 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  27.52 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  22.52 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  27.35 
 
 
161 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  26.4 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  22.73 
 
 
112 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
226 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  24.29 
 
 
380 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  30.33 
 
 
300 aa  42  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  21.37 
 
 
124 aa  42  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  21.37 
 
 
146 aa  42  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>