104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3711 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  75.92 
 
 		 188 aa  305  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  43.64 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  43.64 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 237 aa  98.2  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  37.32 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  32.8 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  31.71 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  32.84 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.53 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  27.45 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  26.72 
 
 		 149 aa  51.2  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  28.1 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.35 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  28.16 
 
 		 111 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.16 
 
 		 123 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  27.87 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  29.31 
 
 		 132 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  26.67 
 
 		 133 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  25.89 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  31.13 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  30.39 
 
 		 125 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.32 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 142 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  27.5 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  26.42 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  25.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  28.33 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  27.59 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  26.96 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  25.2 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 124 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  26.27 
 
 		 124 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  24.14 
 
 		 221 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 107 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  27.93 
 
 		 406 aa  45.1  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 116 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 116 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  24.6 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  26.92 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  25.24 
 
 		 111 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  23.46 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  25.41 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  23.81 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  28.36 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  26.67 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  23.81 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  25.47 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.73 
 
 		 247 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  23.42 
 
 		 140 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  23.42 
 
 		 140 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  22.69 
 
 		 380 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  23.42 
 
 		 140 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  23.42 
 
 		 140 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  28.71 
 
 		 112 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  21.55 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  24.56 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  24.79 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  23.42 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  23.81 
 
 		 151 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 228 aa  41.2  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>