110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1929 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  75.92 
 
 		 195 aa  305  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 237 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  34.09 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  40.85 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  42.73 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  42.73 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  40.3 
 
 		 216 aa  97.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  32.53 
 
 		 241 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 145 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  31.34 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  26.18 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  29.41 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.16 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  27.68 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  33.02 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  28.1 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  27.05 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  26.09 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 111 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  24.11 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  26.17 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 142 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  23.48 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  28.07 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.97 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  27.73 
 
 		 130 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 		 113 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  25.44 
 
 		 141 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  25.22 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  22.41 
 
 		 221 aa  45.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  26.02 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 290 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 125 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  25.23 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.37 
 
 		 107 aa  45.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  25.41 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  25.66 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  26.5 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  27.27 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  25.83 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  26.98 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  26.27 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  26.27 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  26.27 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  26.27 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  26.27 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  24.39 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  24.35 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  23.42 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  27.93 
 
 		 406 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  27.35 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  27.05 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.05 
 
 		 471 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  25.22 
 
 		 169 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  26.87 
 
 		 119 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  24.81 
 
 		 189 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  25.95 
 
 		 144 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  27.12 
 
 		 137 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  30.69 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  22.61 
 
 		 112 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  24.76 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 153 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>