34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2268 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4882  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.70517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2268  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0627925  normal  0.0852757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1668  rhodanese-like protein  41.97 
 
 		 218 aa  141  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3711  rhodanese domain-containing protein  42.14 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0309402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1650  rhodanese-like protein  38 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000948932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1929  rhodanese-like protein  45.16 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.6245300000000003e-19  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1543  rhodanese domain-containing protein  35.68 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1735  rhodanese-like protein  31.72 
 
 		 241 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 211 aa  84.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  27.48 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  30.22 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  26.85 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.3 
 
 		 793 aa  51.6  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  27.47 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  28.97 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  28.46 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 164 aa  44.7  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  26.96 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  28.83 
 
 		 112 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  27.34 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  27.81 
 
 		 454 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  24.78 
 
 		 114 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  26.67 
 
 		 172 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2612  rhodanese-like domain-containing protein  28.36 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 112 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  51.16 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>