290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0273 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  276  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.96 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  29.93 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  29.52 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  27.94 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  25.76 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  26.47 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  25.76 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.94 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  32.43 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  37.11 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  32.43 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  32.58 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  31.62 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  25.76 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  26.83 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  27.48 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1028  Rhodanese domain protein  28.26 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.07 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  31.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  26.21 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  33.94 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  33.04 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  28.47 
 
 		 353 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  27.2 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  30.11 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  32.82 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  31.09 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  30.37 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.15 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  28.09 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 432 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.36 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  23.48 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  23.48 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  30.15 
 
 		 388 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  23.48 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  31.88 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  28.18 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  25.56 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  28.21 
 
 		 271 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.3 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  26.42 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 197 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  26.42 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.24 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  31.31 
 
 		 363 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 272 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  29.2 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  27.36 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>