33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2174 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  96.77 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  86.81 
 
 		 182 aa  332  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  58.56 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  46.2 
 
 		 212 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  41.94 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  40.76 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  39.87 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  39.24 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  37.75 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  37.8 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  32.24 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  34.55 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  34.55 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  36.17 
 
 		 195 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  33.13 
 
 		 175 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  30.23 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  33.12 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  34.04 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  26.81 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 142 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 136 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  23.78 
 
 		 380 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  25.4 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  37.04 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  34.25 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  40.74 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  29.2 
 
 		 141 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  29.2 
 
 		 141 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 173 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>