23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4226 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  39.9 
 
 		 212 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  41.62 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  41.07 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  42.5 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  44.74 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  43.88 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  44.37 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  41.18 
 
 		 181 aa  111  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  42.86 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  40.11 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  36.9 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  36.36 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  40.79 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  40.91 
 
 		 175 aa  95.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  38.71 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  37.9 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  37.4 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  38.52 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  43.82 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.52 
 
 		 388 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>