28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5755 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  89.47 
 
 		 173 aa  258  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  61.76 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  58.71 
 
 		 187 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  59.75 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  57.33 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  53.46 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  51.92 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  48.82 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  39.56 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  47.13 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  40.12 
 
 		 186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  37.91 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  46.5 
 
 		 195 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  44.74 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  47.92 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  41.57 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  38.07 
 
 		 191 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  39.55 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  40.86 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  43.84 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  28.26 
 
 		 380 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  38.6 
 
 		 377 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  25.15 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>