33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5980 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  89.03 
 
 		 177 aa  284  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  57.99 
 
 		 181 aa  196  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  64.24 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  56.77 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  60.38 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  50 
 
 		 175 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  54.49 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  48.84 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  49.68 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  46.1 
 
 		 212 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  48.95 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  39.88 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  40.36 
 
 		 200 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  44.72 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  36.87 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  44.1 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  39.31 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  43.2 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  44.14 
 
 		 198 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  30.72 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.29 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  37.7 
 
 		 173 aa  44.3  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  28.41 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 179 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  40.35 
 
 		 377 aa  42  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  30.99 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  30.99 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  30.99 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  30.99 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  30.99 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>