24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1774 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  98.97 
 
 		 195 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  87.18 
 
 		 195 aa  304  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  64.85 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  52.88 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  49.32 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  46.48 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  44.44 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  44.52 
 
 		 175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  45.89 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  47.29 
 
 		 173 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  40.97 
 
 		 182 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  43.08 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  33.94 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  35.46 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  37.06 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  38.73 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  34.76 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  36.36 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  33.57 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  42.7 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  45.65 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  25.33 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  24.03 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>