24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3184 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  100 
 
 		 200 aa  401  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  52.88 
 
 		 195 aa  197  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  52.88 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  55.69 
 
 		 195 aa  187  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  50.6 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  41.73 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  41.84 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  40.14 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  32.24 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  37.93 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  37.76 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  34.9 
 
 		 186 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  37.33 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  41.38 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  31.95 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  37.5 
 
 		 175 aa  94.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  31.93 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  30.54 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  35.42 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  35.62 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  33.93 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  46.05 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>