33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3137 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  87.91 
 
 		 186 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  86.81 
 
 		 186 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  61.93 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  43.67 
 
 		 212 aa  134  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  42.58 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  39.49 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  40.43 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  36.11 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  40.91 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  39.74 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  38.59 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  35.98 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  35 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  35.53 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  31.95 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  35.53 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  34.76 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  34.76 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  35.46 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  30.92 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  25.36 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 136 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  27.21 
 
 		 380 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  24.29 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  26.23 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  42.59 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  24.34 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  27.03 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  27.03 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>