30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2666 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  96.77 
 
 		 186 aa  343  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  87.91 
 
 		 182 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  59.66 
 
 		 191 aa  221  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  45.62 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  43.87 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  41.4 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  41.08 
 
 		 193 aa  120  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  39.24 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  39.22 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  35.56 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  38.41 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  37.2 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  32.24 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  33.94 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  33.94 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  35.46 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  33.13 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  33.77 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  30.23 
 
 		 175 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  32.62 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  26.81 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  23.78 
 
 		 380 aa  47.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 136 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  35.19 
 
 		 112 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  43.48 
 
 		 144 aa  42  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  34.25 
 
 		 173 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  24.87 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>