23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5950 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  60.53 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  58.82 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  58.94 
 
 		 195 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  54.66 
 
 		 182 aa  187  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  56.58 
 
 		 173 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  46.82 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  46.82 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  48.1 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  49.03 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  41.76 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  40.66 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  40.32 
 
 		 212 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  41.76 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  38.12 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  34.05 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  33.51 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  37.06 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  35.42 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  30.69 
 
 		 377 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>