23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0479 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0479  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.678283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  64.67 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5950  hypothetical protein  54.66 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  58.97 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1778  hypothetical protein  57.62 
 
 		 195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0417428  normal  0.25156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  50.87 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  50.29 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  60.53 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1942  hypothetical protein  49.68 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.916806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0023  rhodanese  47.8 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  44.24 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0685  hypothetical protein  43.02 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382868  normal  0.795521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  36.61 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  35.52 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1737  rhodanese  44.44 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.241778  normal  0.511151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1944  hypothetical protein  37.28 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.80802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4226  hypothetical protein  39.86 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.969803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1963  rhodanese  44.14 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.159462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  37.72 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2110  rhodanese  40.97 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1774  rhodanese  40.97 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>