More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0713 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  295  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  30.67 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  28.69 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  36.89 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.33 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0273  rhodanese domain-containing protein  32.52 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  38.14 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.9 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  31.3 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1239  rhodanese  27.98 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42785  normal  0.523254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2581  rhodanese  27.38 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  31.47 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.36 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.3 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  29.5 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  32.65 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.44 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.28 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.13 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.94 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.67 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 377 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  30 
 
 		 271 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  30.53 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  31.47 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  28.46 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 480 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  34.65 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  37.27 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.51 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.95 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 		 271 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  31.96 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  28.78 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  28.78 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 		 480 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  38.18 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  29.14 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  29.91 
 
 		 553 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 153 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  28.06 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  26.81 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  26.8 
 
 		 252 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  26.81 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  36.04 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  30.56 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  29.46 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  34.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 438 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.44 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  29.32 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  29.09 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  34.74 
 
 		 401 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5755  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.665172 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  26.79 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  27.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  27.68 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>