292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3920 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  346  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  48.78 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  47.5 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  46.54 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  45.57 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.53 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  42.27 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  28.39 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 		 252 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  33.54 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  40.24 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 247 aa  57.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  31.13 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.41 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  26.81 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  28.04 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  32.63 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  32.29 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  26.28 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 		 269 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1353  rhodanese domain-containing protein  34.23 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  26.95 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  32.18 
 
 		 106 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 353 aa  51.6  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 480 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  30.19 
 
 		 112 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 231 aa  50.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  32.98 
 
 		 107 aa  50.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  33.65 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  27.87 
 
 		 125 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  27.62 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 480 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  31.37 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  25.96 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  30 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  30 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  26.8 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  29 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  26.8 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  29 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  28.43 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  30 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  27.54 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  27.54 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  31.76 
 
 		 271 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  26.96 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  27.55 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 		 114 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 		 221 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  29.36 
 
 		 346 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3743  hypothetical protein  28.74 
 
 		 237 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  28.07 
 
 		 423 aa  48.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  25.53 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 		 218 aa  48.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  26.73 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  28.1 
 
 		 114 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  48.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  23.91 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  31.52 
 
 		 271 aa  47.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  27.72 
 
 		 107 aa  47.8  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 		 135 aa  47.4  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 108 aa  47.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 224 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 241 aa  47.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 211 aa  47.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  23.19 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  28.42 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.41 
 
 		 386 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2729  hydrolase  31.52 
 
 		 456 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.252968  decreased coverage  0.0000538772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>