More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3018 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  64.12 
 
 		 169 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  49.4 
 
 		 167 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  42.07 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  41.07 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 252 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  31.21 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 406 aa  67.8  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.25 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.25 
 
 		 480 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 		 432 aa  64.3  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  44.32 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  32.74 
 
 		 380 aa  61.6  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 		 308 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  34.69 
 
 		 375 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  33.68 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  31.63 
 
 		 130 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  30.1 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.04 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  32.38 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  33.71 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  26.85 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  29 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1819  Rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.23 
 
 		 550 aa  54.3  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  29.81 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  30.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  33.75 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  29.81 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 112 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  26.09 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  27.17 
 
 		 122 aa  52.4  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  30.61 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 108 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  30.61 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 		 133 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  34.34 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  25.77 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 301 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  33 
 
 		 254 aa  51.6  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2099  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0523024  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2871  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  35.48 
 
 		 553 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  26.92 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 227 aa  51.2  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  31.18 
 
 		 108 aa  50.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  28.71 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>