More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0923 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  100 
 
 
110 aa  229  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  51 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  57.83 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 
102 aa  105  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  56.1 
 
 
106 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  57.5 
 
 
106 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  58.75 
 
 
110 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  58.75 
 
 
110 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  56.1 
 
 
109 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  50.51 
 
 
110 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  46.39 
 
 
102 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  50.54 
 
 
108 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  50 
 
 
101 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  58.75 
 
 
109 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  57.5 
 
 
110 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  48.48 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  45.36 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  46.23 
 
 
108 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  46.88 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
101 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
123 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
101 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  52.7 
 
 
107 aa  94  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  53.75 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  47.52 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  51.81 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
102 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  46.46 
 
 
106 aa  90.1  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  47.5 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  46.99 
 
 
107 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  46.51 
 
 
110 aa  87.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  51.35 
 
 
106 aa  87  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
272 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  50.65 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  49.33 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  46.99 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  44.71 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  43.53 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  44.71 
 
 
108 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  45.45 
 
 
245 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  40.4 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  44.58 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  44.58 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  44.58 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  44.58 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  46.05 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  44.05 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 
656 aa  75.5  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  28.87 
 
 
108 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  41.89 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  39.24 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  39.24 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36.36 
 
 
820 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  36.26 
 
 
711 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.41 
 
 
361 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  37.18 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.04 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  35.29 
 
 
258 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 
284 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  34.38 
 
 
216 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  38.96 
 
 
480 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.77 
 
 
279 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.31 
 
 
392 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  38.16 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  35.14 
 
 
277 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
271 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  32.99 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  43.21 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>