100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0382 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  100 
 
 
274 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  42.76 
 
 
172 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  40.14 
 
 
177 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2783  hypothetical protein  47.73 
 
 
93 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00810917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  35.04 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  33.74 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  33.13 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 
169 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1353  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 
177 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192542  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  36.08 
 
 
170 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  34 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  36.46 
 
 
221 aa  57.4  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  34.58 
 
 
112 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  36.28 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
145 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
406 aa  52.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.25 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  34.41 
 
 
169 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  34.88 
 
 
171 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  33 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  35.35 
 
 
218 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  33.65 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  30.21 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  32.48 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  26.88 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
112 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
134 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
171 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 
143 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
226 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
223 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  25.53 
 
 
146 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
185 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
252 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  35.11 
 
 
355 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1961  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
128 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 
128 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 
221 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 
141 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.63 
 
 
480 aa  45.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  26.88 
 
 
144 aa  45.4  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  25.4 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1575  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00593854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  25.95 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.44 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  25.66 
 
 
363 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1901  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 
159 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2261  sulfurtransferase  28.12 
 
 
271 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  33.67 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  33.67 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  33.67 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  33.67 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.32 
 
 
2449 aa  43.9  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 
148 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1690  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 
435 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
235 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01714  hypothetical protein  31.91 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.526406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1885  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301691  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0916  hypothetical protein  30.65 
 
 
328 aa  43.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  27.34 
 
 
144 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01726  predicted thiosulfate sulfur transferase  31.91 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.382784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1841  rhodanese-like domain-containing protein  31.91 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
224 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2476  rhodanese-like domain protein  31.91 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1433  rhodanese-like domain-containing protein  31.91 
 
 
435 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.587223  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  36.56 
 
 
109 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
231 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1980  rhodanese-like domain-containing protein  31.91 
 
 
435 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0372408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1875  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
435 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30 
 
 
148 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  41.82 
 
 
350 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2006  rhodanese-like domain protein  31.91 
 
 
428 aa  42.7  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  32.26 
 
 
3409 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  29.52 
 
 
142 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  28.16 
 
 
227 aa  42.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
132 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>