15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2783 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2783  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00810917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  47.73 
 
 		 274 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  40.96 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  36.84 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 		 252 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  29.58 
 
 		 252 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>