More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3059 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0382  Rhodanese domain protein  40.14 
 
 		 274 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0199253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  40.45 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  28.39 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  35.92 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  31.73 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2783  hypothetical protein  36.49 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00810917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4079  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.361854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2873  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 327 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 252 aa  57.8  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2794  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.718794  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  36.63 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  27.67 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  29.11 
 
 		 321 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  29.11 
 
 		 321 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  29.58 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0912  transcription regulator ArsR  37.97 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 146 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3937  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  35.16 
 
 		 423 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  33.01 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  32.08 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  33.59 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  38.27 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  30.51 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  31.37 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  26.9 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.17 
 
 		 553 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  32.08 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 454 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 230 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  33.71 
 
 		 112 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 140 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  32.95 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  28.97 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  31.97 
 
 		 130 aa  51.6  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  33.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  28 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 124 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  28 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  29.2 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  26.32 
 
 		 125 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 112 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  29.41 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  30.34 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  31.96 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  29.17 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3427  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.299912  normal  0.0245638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  28.72 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  29.17 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>