More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1205 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1382  rhodanese-related sulfurtransferase  49.57 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000754094  hitchhiker  0.000000000000041245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  40.91 
 
 
127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 
127 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.64 
 
 
127 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  43.36 
 
 
127 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  38.64 
 
 
127 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  49.02 
 
 
128 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  49.02 
 
 
128 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  48.04 
 
 
128 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  48 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  46.53 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0472  rhodanese-like domain-containing protein  38.89 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2310  hypothetical protein  36.11 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000779095  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1702  rhodanese-related sulfurtransferase  29.23 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
277 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
278 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  35.42 
 
 
553 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  32.74 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  40.24 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
220 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  29.59 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 
177 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.1 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31.67 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 
284 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  30.49 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  28.23 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  27.05 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  32 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 
123 aa  54.7  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  34.62 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  29 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  26.72 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  24.35 
 
 
127 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  35.06 
 
 
711 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  30.83 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  29.27 
 
 
125 aa  52.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  30.25 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.25 
 
 
566 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.25 
 
 
566 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.13 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
535 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.67 
 
 
121 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 
463 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  31.33 
 
 
288 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.71 
 
 
470 aa  52  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  27.27 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 
238 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  30.83 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  30.51 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 
140 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
221 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
221 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>