More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1382 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1382  rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
132 aa  269  9e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000754094  hitchhiker  0.000000000000041245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  50.39 
 
 
137 aa  126  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  45.83 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  45.83 
 
 
127 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  45 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  48.11 
 
 
127 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  51.43 
 
 
128 aa  106  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  49.04 
 
 
124 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  48.08 
 
 
124 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  47.17 
 
 
127 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  49.52 
 
 
128 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  49.52 
 
 
128 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0472  rhodanese-like domain-containing protein  41.13 
 
 
126 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1702  rhodanese-related sulfurtransferase  37.21 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 
277 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  31.9 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  35.06 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  30.83 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  27.87 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  30 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 
284 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  30.86 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  36.59 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 
389 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  42.03 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  30.66 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  34.82 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2310  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000779095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  31.45 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  34.52 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.36 
 
 
566 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.36 
 
 
566 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  29.51 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
137 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  30.09 
 
 
150 aa  53.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 
415 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.06 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  30.11 
 
 
288 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 
279 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34.04 
 
 
229 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  40.91 
 
 
565 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  27.97 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  27.64 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  29.47 
 
 
198 aa  52  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  25 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  28.92 
 
 
280 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  32.14 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.97 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  31.17 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 
220 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  27.91 
 
 
123 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  30.39 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  29.55 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1554  rhodanese-like sulfurtransferase protein  34.91 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000229638  normal  0.157594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  31.4 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  31.71 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  28.7 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  32.1 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  31.4 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  31.4 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  31.76 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  36 
 
 
345 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  35.37 
 
 
527 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  29.31 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  35.8 
 
 
527 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  30.77 
 
 
106 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  25.78 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31.76 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  25.81 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  26.45 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>