More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1098 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  83.59 
 
 		 128 aa  213  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  83.59 
 
 		 128 aa  213  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  45.67 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  45.67 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  51.82 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  48.03 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1382  rhodanese-related sulfurtransferase  51.43 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000754094  hitchhiker  0.000000000000041245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1205  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252332  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0472  rhodanese-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  28.7 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1702  rhodanese-related sulfurtransferase  41.98 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.57671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.73 
 
 		 566 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  36.13 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  36.13 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.13 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.67 
 
 		 562 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  26.55 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.73 
 
 		 566 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  28.69 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.08 
 
 		 831 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.15 
 
 		 189 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.63 
 
 		 387 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.99 
 
 		 938 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  23.21 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  36.47 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0417  Rhodanese domain protein  34.67 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.678691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  30.28 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  34.57 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.38 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  28.21 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  33.88 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.58 
 
 		 568 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  37.04 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.78 
 
 		 817 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0941  rhodanese-domain protein  30.28 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000120327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  36.08 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  32.93 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  34.78 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  33.78 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 484 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.66 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.66 
 
 		 478 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  29 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36.49 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.66 
 
 		 484 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2271  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  35 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  37.66 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>