More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4649 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2519  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
244 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  29.9 
 
 
229 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 
222 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  30.77 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
148 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  35.14 
 
 
108 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  31.03 
 
 
98 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  37.35 
 
 
144 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 
141 aa  62.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  36 
 
 
116 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  36 
 
 
108 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.35 
 
 
148 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.92 
 
 
123 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 
145 aa  62  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  30.95 
 
 
98 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
124 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  29.76 
 
 
98 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  33.64 
 
 
109 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  27.85 
 
 
111 aa  60.1  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  37.04 
 
 
617 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 
116 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 
124 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  35.21 
 
 
112 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  33.78 
 
 
108 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  33.72 
 
 
143 aa  58.9  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  29.27 
 
 
150 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  32.14 
 
 
108 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  25.47 
 
 
150 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  58.5  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  34.25 
 
 
108 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.07 
 
 
127 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  29.89 
 
 
141 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  28.69 
 
 
127 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  30.53 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  33.33 
 
 
111 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  28.17 
 
 
106 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
141 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  33.33 
 
 
108 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  35.63 
 
 
116 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  25 
 
 
141 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  30.77 
 
 
110 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  27.21 
 
 
197 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.77 
 
 
146 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  27.84 
 
 
145 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  38.03 
 
 
107 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  25.26 
 
 
109 aa  55.5  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.77 
 
 
146 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.11 
 
 
108 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.11 
 
 
108 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  26.83 
 
 
144 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  30.77 
 
 
106 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  32.17 
 
 
125 aa  55.1  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  27.36 
 
 
144 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  31.75 
 
 
127 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  37.5 
 
 
134 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  31.43 
 
 
110 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  31.75 
 
 
127 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  29.89 
 
 
108 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  36.76 
 
 
107 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  37.5 
 
 
141 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  32 
 
 
107 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  29.41 
 
 
101 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
356 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  32.05 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.77 
 
 
108 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  25.71 
 
 
150 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
116 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  37.18 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.91 
 
 
107 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  30 
 
 
108 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>