More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6383 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  59.57 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  62.96 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  52.63 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  51.58 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  48.39 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  48.31 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  45.83 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  46.32 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  53.01 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  46.81 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  51.81 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  52.38 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  50 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  48.31 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  46.32 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  45.45 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  46.59 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  41.41 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  42.22 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  44.32 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  48.19 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  43.96 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  45.16 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  49.41 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  48.72 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  46.25 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.43 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  48.72 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1624  thioredoxin domain-containing protein  43.01 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.96 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  41.76 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  41.94 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  46.07 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  47.06 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  46.84 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.74 
 
 		 108 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  46.34 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  43.02 
 
 		 106 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  48.1 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  46.99 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  46.25 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  42.53 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  44.19 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  41.38 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.63 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  47.44 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01370  thioredoxin C-2  41.49 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.602659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  41.57 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  42.53 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  42.27 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  43.33 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  43.48 
 
 		 98 aa  90.5  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  40.62 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  44.33 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  43.48 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  43.16 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  41.3 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  47.44 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  47.25 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  40.82 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  42.86 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  49.37 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  41.3 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  44.21 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  39.39 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  47.95 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  50.62 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  40.22 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  49.44 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  38.46 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  47.13 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  41.86 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  40.22 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  47.67 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  43.02 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>