More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4260 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  217  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  66.67 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  66.67 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  63.81 
 
 		 105 aa  150  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  61.54 
 
 		 107 aa  146  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  60.95 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  57.14 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  50 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  47.96 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  50 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  42.31 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  46.32 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  46.24 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  44.09 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  39.42 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  47.06 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  42.31 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  46.32 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  40.38 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  42.86 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  42.86 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  40.86 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  41.05 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  41.35 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  39.18 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  40 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  46.74 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  42.27 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  42.27 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  40.78 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  39.05 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  39.42 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  44.71 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  47.56 
 
 		 107 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  43.62 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  37.86 
 
 		 107 aa  90.9  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  40.82 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  38.3 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  38.3 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  45.24 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  38.78 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  40.86 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  39.18 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  45.24 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  44.74 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  39.18 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1247  thioredoxin  38.83 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000845354  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  43.53 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  40.82 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  41.18 
 
 		 277 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  43.53 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  41.05 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  46.34 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  40.82 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  42.27 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  40.78 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  46.34 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  37.63 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  39.8 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  39.8 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  48.78 
 
 		 286 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  43.68 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  43.62 
 
 		 304 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  38.46 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  38.14 
 
 		 150 aa  87.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  42.7 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  36.63 
 
 		 106 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  41.05 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40.78 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  38.78 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  39.58 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  45.05 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40.43 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  44.58 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  44.58 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  39.8 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  42.17 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  38.14 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  36.08 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  38.14 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  40.21 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  34.74 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  42.17 
 
 		 281 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5108  Thioredoxin domain protein  35.45 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  43.53 
 
 		 109 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.37 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  36.08 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  41.94 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>