More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  100 
 
 
108 aa  223  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  78.1 
 
 
108 aa  176  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  75.24 
 
 
108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  70.48 
 
 
110 aa  160  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  69.81 
 
 
109 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  69.81 
 
 
109 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  69.81 
 
 
109 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  69.81 
 
 
109 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  69.23 
 
 
116 aa  158  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  70.3 
 
 
112 aa  157  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  67.59 
 
 
108 aa  156  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  66.35 
 
 
107 aa  155  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  70.59 
 
 
108 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  66.67 
 
 
108 aa  150  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  67.71 
 
 
111 aa  141  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  59.81 
 
 
107 aa  140  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  60 
 
 
106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  60.75 
 
 
108 aa  136  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  55.14 
 
 
107 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  60.61 
 
 
106 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  60 
 
 
106 aa  135  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  57.84 
 
 
107 aa  134  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  56.07 
 
 
108 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  54.21 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  129  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  58.65 
 
 
112 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  55.56 
 
 
110 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  56.44 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  54.63 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  59.22 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  58.65 
 
 
106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.17 
 
 
106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  52.83 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.55 
 
 
115 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  51.4 
 
 
109 aa  124  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  54.81 
 
 
107 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  57.29 
 
 
112 aa  123  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  53.27 
 
 
107 aa  121  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  58.33 
 
 
106 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  49.07 
 
 
109 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  49.53 
 
 
124 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  56.12 
 
 
125 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  50.47 
 
 
107 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50 
 
 
148 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  120  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  49.53 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  57.58 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  57.73 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  48.08 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  49.49 
 
 
108 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50.49 
 
 
107 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  54.81 
 
 
141 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  55.67 
 
 
106 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  47.12 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  56.31 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  59.14 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  59.14 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  53.68 
 
 
108 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  48.6 
 
 
113 aa  117  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  117  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  56.31 
 
 
104 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  52.34 
 
 
108 aa  116  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  56.31 
 
 
104 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  53.19 
 
 
106 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  52.69 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  47.57 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  49 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  50.47 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  114  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  54.74 
 
 
110 aa  115  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  53.12 
 
 
108 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  53.19 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  51.52 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  52.13 
 
 
106 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  53.76 
 
 
108 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  51.52 
 
 
109 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  50.98 
 
 
110 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  52.13 
 
 
106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>