More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2662 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  218  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  44.76 
 
 
106 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  45.19 
 
 
108 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  47 
 
 
109 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  40.38 
 
 
108 aa  101  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  45.1 
 
 
106 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  41.35 
 
 
109 aa  100  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  51.04 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  46 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  47.37 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  43.27 
 
 
112 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  45.71 
 
 
108 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  43.14 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  43.4 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  42.31 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  44.12 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  42.45 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  46.39 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  43.14 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  42.45 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  45 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  97.1  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  45.05 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  44.33 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  45 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  45.36 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  45.98 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  41.35 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  44.23 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  43.88 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  43.75 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  47.96 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  43.88 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  95.9  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  46 
 
 
108 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  36.54 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  38.68 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  42.27 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  43.3 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  43.93 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  47.06 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  45.05 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  45.05 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  50 
 
 
106 aa  94.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  40.57 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  43.4 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  44.33 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  46.39 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  42.31 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  45.36 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  41.35 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  42.27 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  41 
 
 
108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  41.35 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.38 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  45.26 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  44 
 
 
108 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  41.35 
 
 
109 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  41.18 
 
 
106 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>