More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13949 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  100 
 
 
116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  83.02 
 
 
109 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  79.46 
 
 
110 aa  179  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  81.13 
 
 
109 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  81.13 
 
 
109 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  81.13 
 
 
109 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  69.23 
 
 
108 aa  158  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  71.15 
 
 
112 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  67.92 
 
 
108 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  63.81 
 
 
107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  65.38 
 
 
108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  66.02 
 
 
108 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  67.71 
 
 
111 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  61.32 
 
 
107 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  61.32 
 
 
108 aa  140  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  64.21 
 
 
107 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  60 
 
 
107 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  60.78 
 
 
108 aa  135  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  55.66 
 
 
107 aa  133  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  57.14 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  55.66 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  60.19 
 
 
110 aa  126  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  57.14 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  60.58 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  56 
 
 
106 aa  124  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  59.6 
 
 
109 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  68.89 
 
 
141 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  56.7 
 
 
107 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.77 
 
 
109 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  58 
 
 
106 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  52.83 
 
 
108 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  51.96 
 
 
106 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  56.7 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  58.25 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  54.81 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  54.81 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  55.88 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  55.21 
 
 
106 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  55.1 
 
 
108 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  48.62 
 
 
115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  54.64 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  58.76 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  58.76 
 
 
104 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  54.64 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  57.29 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  61.54 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  58.76 
 
 
108 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  58.76 
 
 
108 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  55.34 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  55.34 
 
 
124 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  53.21 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  55.45 
 
 
104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  49.52 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  53.4 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  52.53 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  52.53 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.67 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  52.34 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  53.4 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  54.08 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  52.53 
 
 
108 aa  114  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  50.96 
 
 
107 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  53.92 
 
 
107 aa  114  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  55.32 
 
 
133 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  53.4 
 
 
108 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  54.74 
 
 
108 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  55.56 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  50.48 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  51.92 
 
 
108 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  51.92 
 
 
108 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.52 
 
 
120 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  54.55 
 
 
111 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  50.49 
 
 
106 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  52.43 
 
 
259 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  114  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  55.67 
 
 
108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  53.85 
 
 
125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  52.53 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  54.9 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  54.84 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>