More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1024 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  62.22 
 
 		 90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  62.92 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  57.3 
 
 		 102 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  53.57 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1658  thioredoxin domain-containing protein  51.61 
 
 		 95 aa  103  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0579498  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  52.94 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  51.69 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  58.02 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  43.02 
 
 		 105 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  49.4 
 
 		 88 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  50 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  43.68 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  49.38 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  42.35 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  47.56 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  41.86 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6383  thioredoxin  48.81 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.920622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  48.15 
 
 		 89 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  39.77 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  40.96 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  37.93 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  43.37 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  41.38 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  37.93 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  38.82 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  38.1 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  40.48 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  40.96 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  39.76 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  37.21 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  40.96 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  44.44 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  40.24 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  39.76 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  39.77 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  44.74 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  41.38 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  40.7 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  39.53 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  43.84 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  41.67 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  43.75 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  41.38 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  41.38 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  38.82 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  36.9 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  34.09 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  39.08 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  41.18 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  38.55 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  39.29 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.86 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.48 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  39.76 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  37.21 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43.18 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  38.55 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  39.29 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  38.64 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  38.64 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  42.25 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  38.55 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  38.82 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  40.96 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  37.21 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  37.21 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  40.48 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  37.8 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  33.73 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  39.76 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  37.8 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  37.35 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  39.29 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>