More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0539 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  59.62 
 
 		 104 aa  144  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  63.73 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  58.42 
 
 		 104 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  58.65 
 
 		 104 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  52.88 
 
 		 104 aa  130  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.96 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  54.37 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  51.92 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  50 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  47.47 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  46.23 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  45.19 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  45.19 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  50.62 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  43.88 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  45 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  42 
 
 		 108 aa  98.6  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  43.88 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  41.51 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  38 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4349  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  46.53 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4648  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4417  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4256  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4268  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0606  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4633  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4649  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4758  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4629  thioredoxin  41.75 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0273149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  43.4 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.46 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  46.6 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  45.54 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  42.45 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  44.23 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  41.35 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  41.9 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  42.42 
 
 		 238 aa  93.6  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  44 
 
 		 259 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  41.51 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  42.57 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  45 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  41.51 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  44 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  43 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  46.43 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  44.34 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  43 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  44 
 
 		 110 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  45.24 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  47.83 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  39.18 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  45.24 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  43 
 
 		 107 aa  90.5  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  43.3 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  42.99 
 
 		 223 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  42.17 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  42.16 
 
 		 117 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  41.24 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  45.24 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  41.12 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  44.55 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.56 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  41.51 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  40.4 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  40.78 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  43.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  44.55 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.88 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>