More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1563 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
100 aa  205  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  93.26 
 
 
89 aa  174  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  86.52 
 
 
88 aa  157  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  76.4 
 
 
89 aa  144  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  73.03 
 
 
88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  44.58 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  46.43 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  46.43 
 
 
104 aa  90.1  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  44.05 
 
 
105 aa  90.1  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  50 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  45.24 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  44.58 
 
 
102 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  44.58 
 
 
103 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  48.24 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  46.43 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  41.67 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  49.38 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  44.05 
 
 
104 aa  86.7  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  39.39 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  53.52 
 
 
282 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  53.42 
 
 
282 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  46.91 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  44.05 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  44.58 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  52.05 
 
 
282 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  53.42 
 
 
282 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  53.42 
 
 
282 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  44.05 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  38.82 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  52.11 
 
 
282 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.37 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  52.11 
 
 
282 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  37.63 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  45.78 
 
 
104 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.45 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  38.2 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  45.57 
 
 
137 aa  83.6  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  45.12 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  47.13 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  44.3 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  51.43 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  51.43 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  44.32 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  40.96 
 
 
105 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  40.48 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  51.43 
 
 
301 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  44.58 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  43.68 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  44.05 
 
 
89 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  40.91 
 
 
280 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  44.58 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  41.18 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  39.02 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  43.68 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  35.16 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  51.43 
 
 
918 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  42.17 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  41.38 
 
 
285 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  51.43 
 
 
282 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  41.11 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  39.33 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  39.51 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  41.38 
 
 
285 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  42.17 
 
 
110 aa  80.1  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.96 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  40.74 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.74 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  38.1 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.74 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.74 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  40.23 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  37.5 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  41.33 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  42.68 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  38.89 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  43.21 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  41.25 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  38.46 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  44 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  40.96 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  46.34 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  41.25 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  42.17 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  41.25 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  44 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  34.48 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  39.08 
 
 
280 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  37.08 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  37.08 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.35 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  37.08 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  38.55 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  38.55 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  40.26 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  41.46 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  39.76 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  38.55 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  36.9 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>