More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1200 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  47.87 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  44.68 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  48.84 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  46.15 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  48.28 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  46.94 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  43.75 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  49.43 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  49.43 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  45.24 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  45.05 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  48.28 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  45.45 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  43.82 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  45.68 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  47.56 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.16 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.95 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  44.05 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  40.91 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.05 
 
 		 107 aa  94  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  45.88 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  38.95 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  44.05 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  43.18 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  43.18 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  42.7 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  44.05 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  45.88 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  42.22 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  41.05 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.35 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  40.86 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  45.78 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  40.23 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  38.3 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  37.23 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  38.3 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  42.86 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  38.3 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  37.23 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  38.1 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  43.75 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  36.56 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  37.78 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  38.3 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  45.68 
 
 		 259 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  36.9 
 
 		 105 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  37.89 
 
 		 223 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  38.46 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  44.05 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  43.37 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  41.67 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  38.71 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  41.98 
 
 		 109 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  39.36 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  38.82 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  43.37 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  39.36 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  36.17 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  41.98 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  37.23 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  43.16 
 
 		 107 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  41.67 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  38.3 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  44.3 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.65 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  46.58 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>