More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2211 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  219  8e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  59.26 
 
 		 108 aa  147  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  60.38 
 
 		 109 aa  146  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  62.38 
 
 		 223 aa  142  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  137  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  56.44 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.43 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  56.44 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  51.85 
 
 		 120 aa  129  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  52.78 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.43 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50.47 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  127  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  54.46 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  51.85 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  53.47 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  56.44 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  48.15 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  50 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  51.85 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  51.4 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  51.4 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  51.4 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  52.83 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  48.51 
 
 		 123 aa  123  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  51.96 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  49.07 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  48.6 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  57.14 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  46.3 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  48.15 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  49.53 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  47.22 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.96 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.96 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  44.44 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>