More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1830 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  220  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  85.05 
 
 
107 aa  193  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  85.98 
 
 
107 aa  193  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  84.11 
 
 
107 aa  192  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  83.18 
 
 
107 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  83.18 
 
 
107 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  81.31 
 
 
109 aa  186  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  74.77 
 
 
124 aa  180  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  74.77 
 
 
148 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  76.64 
 
 
107 aa  179  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  74.77 
 
 
107 aa  179  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  74.77 
 
 
107 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  77.57 
 
 
107 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  80.2 
 
 
125 aa  177  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  74.77 
 
 
107 aa  176  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  73.83 
 
 
107 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  66.98 
 
 
123 aa  168  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  74.26 
 
 
108 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  72.9 
 
 
110 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  61 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  58 
 
 
120 aa  139  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  58 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  57 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  59.05 
 
 
105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.18 
 
 
115 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  57.55 
 
 
106 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  55.88 
 
 
109 aa  136  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  53.77 
 
 
107 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  62.11 
 
 
107 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  61.05 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  52.88 
 
 
106 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  53.92 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  61.05 
 
 
107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  56 
 
 
109 aa  134  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  59.18 
 
 
105 aa  134  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  134  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  56.44 
 
 
109 aa  133  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  57.43 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  58.25 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  57.89 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  57 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  57.01 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  131  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  55.45 
 
 
109 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  54.46 
 
 
106 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  61.05 
 
 
119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  55.45 
 
 
110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  61.05 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  56 
 
 
108 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  53.92 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  54 
 
 
108 aa  130  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  57 
 
 
259 aa  129  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  129  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  56.84 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  52 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  49.04 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  53.47 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  51.4 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  54.46 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  56.84 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  52.34 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.08 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  60 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.21 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  57.73 
 
 
108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  54 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  54 
 
 
109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  60.22 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  52.34 
 
 
112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  53.47 
 
 
106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  54 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  52.48 
 
 
108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  53.33 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  59.14 
 
 
104 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  54.9 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  51.96 
 
 
105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  53.92 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  53.85 
 
 
106 aa  127  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  49.53 
 
 
107 aa  127  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  53 
 
 
110 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  51.49 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>