More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1412 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  100 
 
 
104 aa  213  8e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  89.42 
 
 
104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  89.42 
 
 
104 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  87.5 
 
 
104 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  80.77 
 
 
104 aa  180  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  78.85 
 
 
104 aa  179  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  79.81 
 
 
104 aa  178  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  75.24 
 
 
105 aa  173  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  72.38 
 
 
105 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  71.43 
 
 
106 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  57.55 
 
 
109 aa  130  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  54.21 
 
 
108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  54.72 
 
 
109 aa  124  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.38 
 
 
115 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  55.66 
 
 
109 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  55.1 
 
 
105 aa  120  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  54.37 
 
 
114 aa  120  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  49.52 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  61.9 
 
 
105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  50.94 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  54.76 
 
 
107 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.79 
 
 
148 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  50.94 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  48.6 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  55.95 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  55.95 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  55.95 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  55.95 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  55.95 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  55.95 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53.57 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.57 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  49.06 
 
 
106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  53.76 
 
 
105 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.38 
 
 
109 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  48.54 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.57 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  55.95 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  47.57 
 
 
107 aa  110  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  53.57 
 
 
107 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  51.49 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  49.51 
 
 
259 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  47.57 
 
 
105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  48.51 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  48.11 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  51.55 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  47.57 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  53.57 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  48.39 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  46.15 
 
 
110 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  47.57 
 
 
107 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  58.82 
 
 
107 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  55.95 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  55.95 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  48.54 
 
 
109 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  55.95 
 
 
105 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  48.45 
 
 
107 aa  106  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  55.56 
 
 
106 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  52.17 
 
 
104 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  53.57 
 
 
125 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  52.17 
 
 
104 aa  106  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  51.19 
 
 
123 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  50 
 
 
135 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  47.52 
 
 
109 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  48.57 
 
 
108 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  44.86 
 
 
109 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  53.75 
 
 
107 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  44 
 
 
107 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  57.65 
 
 
107 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  57.65 
 
 
107 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  41.9 
 
 
109 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  46.6 
 
 
108 aa  104  3e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  51.19 
 
 
105 aa  104  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  52.44 
 
 
107 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  45.45 
 
 
154 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  51.19 
 
 
110 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  104  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  52.38 
 
 
113 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  46.94 
 
 
108 aa  103  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  54.65 
 
 
108 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  54.88 
 
 
106 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  49.51 
 
 
108 aa  103  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50 
 
 
223 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  50.56 
 
 
280 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  51.69 
 
 
281 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  53.66 
 
 
106 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  51.25 
 
 
107 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  47.62 
 
 
114 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  46.6 
 
 
310 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  46.32 
 
 
110 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  50.56 
 
 
281 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>