More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0351 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  100 
 
 
107 aa  221  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  78.5 
 
 
107 aa  184  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  79.44 
 
 
107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  78.5 
 
 
107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  78.5 
 
 
107 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  76.64 
 
 
107 aa  179  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  75.7 
 
 
107 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  75.7 
 
 
107 aa  176  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  72.9 
 
 
109 aa  174  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  71.03 
 
 
107 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  70.09 
 
 
124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  70.09 
 
 
107 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  68.22 
 
 
148 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  70.09 
 
 
107 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  69.16 
 
 
107 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  69.16 
 
 
107 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  69.16 
 
 
107 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  67.29 
 
 
107 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  67.29 
 
 
107 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  71.15 
 
 
125 aa  163  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  72.12 
 
 
108 aa  162  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  65.35 
 
 
123 aa  158  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  74.47 
 
 
110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  60.61 
 
 
106 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  60.2 
 
 
115 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.81 
 
 
109 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  57.55 
 
 
109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  58.25 
 
 
106 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  54.81 
 
 
107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  54.81 
 
 
107 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  55.88 
 
 
105 aa  133  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  54.55 
 
 
107 aa  133  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  58.16 
 
 
107 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52.88 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  57.58 
 
 
110 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  53.85 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  52 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2340  thioredoxin  55.77 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0697906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  57.58 
 
 
107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  52 
 
 
107 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  54.9 
 
 
107 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  53.06 
 
 
107 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  53.06 
 
 
107 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  53.77 
 
 
109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  56.12 
 
 
107 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 
120 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  52.88 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  50.98 
 
 
110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  50.98 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  56 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  52.04 
 
 
107 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  51.4 
 
 
107 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  57.58 
 
 
106 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  52.04 
 
 
107 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  52.88 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  52.48 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  54.55 
 
 
106 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  51.4 
 
 
108 aa  127  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  53.85 
 
 
110 aa  126  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  51.43 
 
 
107 aa  126  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  50 
 
 
110 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  126  9.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  52.94 
 
 
106 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  47.12 
 
 
108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  52.94 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  55.88 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  50.5 
 
 
106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  47.12 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  51 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  46.73 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  56.7 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  57.45 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  52.34 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  52.34 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  53.06 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  50.96 
 
 
109 aa  124  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  54.55 
 
 
109 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  54.55 
 
 
109 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  52.48 
 
 
223 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  56.7 
 
 
106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  47.66 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  54.64 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  54.64 
 
 
106 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  55.56 
 
 
106 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  48 
 
 
114 aa  124  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  48.08 
 
 
110 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  50 
 
 
112 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  50 
 
 
112 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  46.73 
 
 
108 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>