More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2256 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  100 
 
 
105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  62.86 
 
 
105 aa  148  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  58.1 
 
 
107 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  57.14 
 
 
110 aa  144  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  60.19 
 
 
108 aa  140  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  54.29 
 
 
107 aa  134  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  134  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  134  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  58.42 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  58.42 
 
 
107 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.73 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  53.33 
 
 
107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  54.46 
 
 
115 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  58.16 
 
 
107 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  130  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  130  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  55.56 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  56.44 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  57.14 
 
 
107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  51.43 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  57 
 
 
107 aa  128  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  51.46 
 
 
109 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  57.28 
 
 
106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  57.28 
 
 
105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.96 
 
 
107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  54.9 
 
 
106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  51.46 
 
 
109 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  55.45 
 
 
107 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  127  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  53.47 
 
 
107 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  61.05 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  51.96 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  57.28 
 
 
103 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  52.88 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  57.28 
 
 
105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.06 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  52.94 
 
 
107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  52.53 
 
 
106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  52.48 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  58.7 
 
 
105 aa  125  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  51 
 
 
110 aa  124  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  56.31 
 
 
113 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  52.43 
 
 
110 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  55.79 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.46 
 
 
107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.92 
 
 
106 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.48 
 
 
109 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  52 
 
 
107 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  58.76 
 
 
114 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  55.34 
 
 
109 aa  124  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  52.58 
 
 
109 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  56.44 
 
 
106 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  55 
 
 
109 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  52.43 
 
 
107 aa  123  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  50.49 
 
 
150 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  54.9 
 
 
106 aa  122  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  56.99 
 
 
108 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  52.48 
 
 
106 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  55 
 
 
108 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  50 
 
 
107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  57.14 
 
 
108 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  53.92 
 
 
106 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  55.77 
 
 
104 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  56.73 
 
 
104 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  56.73 
 
 
104 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  49.02 
 
 
123 aa  121  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  52 
 
 
107 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  51.49 
 
 
106 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  56.73 
 
 
104 aa  121  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  51.49 
 
 
119 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  55.67 
 
 
110 aa  120  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  45.71 
 
 
106 aa  120  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  53.47 
 
 
109 aa  120  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  50.53 
 
 
108 aa  120  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  55.79 
 
 
109 aa  120  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  53.92 
 
 
106 aa  119  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  51 
 
 
107 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  56.99 
 
 
110 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  55.56 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  54.46 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  50.96 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  56 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  56.73 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  56 
 
 
104 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  61.9 
 
 
104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  52.63 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  52.43 
 
 
104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  55 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  53.33 
 
 
104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>