More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1545 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  100 
 
 		 110 aa  223  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  82.57 
 
 		 114 aa  193  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  77.98 
 
 		 109 aa  187  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  77.98 
 
 		 109 aa  185  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  77.06 
 
 		 109 aa  185  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  77.98 
 
 		 109 aa  184  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  70.64 
 
 		 109 aa  173  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  73.83 
 
 		 108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.81 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  60.19 
 
 		 106 aa  138  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  57.14 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  54.63 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  54.63 
 
 		 112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  53.4 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  53 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  49.07 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  56.25 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  50 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  54.64 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.96 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  51.92 
 
 		 259 aa  123  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  48.15 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  54 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  50.93 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  51.85 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  57.58 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  54.17 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  58.16 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  55.67 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  48.54 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  50.91 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  56.52 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  50.48 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  48.15 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  119  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  54 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  48.15 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  55.56 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  50.93 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  51 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  49.07 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  50 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.32 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  53.77 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  47.71 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>