More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4710 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  215  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  60.95 
 
 		 105 aa  147  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  59 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  56.31 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  54.37 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  56 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  56.19 
 
 		 105 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  56 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  53.54 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  52 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  58 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  58 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  51 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  56.38 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  53.47 
 
 		 114 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  53.54 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  54.17 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  56 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  49.04 
 
 		 107 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  50.49 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  47.06 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  51.49 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  54.26 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  49.02 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  53 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  48.48 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.08 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  49.02 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  49.02 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  52.63 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  50.49 
 
 		 223 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  49.5 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  52 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  48 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  50.5 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  52.63 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  45 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  49.5 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  49.5 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  44.66 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  45.54 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  50.49 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  52.08 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  52.04 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  48.08 
 
 		 110 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  49.51 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  49.5 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  47 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  45.63 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  47 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  44.66 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  44.66 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  46.15 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  47.06 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  43.14 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  45.36 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  48.96 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  45.19 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  51.04 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  47.52 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  46.08 
 
 		 107 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  48.54 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  44.9 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  45.19 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  44.9 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  48 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  49.51 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  44.9 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  48.94 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  51.09 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  47.17 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  43.69 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  47.52 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  45.1 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  43.69 
 
 		 109 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>