More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1456 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  100 
 
 		 108 aa  222  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  65.09 
 
 		 107 aa  151  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  62.96 
 
 		 108 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  67.33 
 
 		 106 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  62.86 
 
 		 106 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  62.5 
 
 		 106 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  63.37 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  63.37 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  61.11 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  62.04 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  62.04 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  63.73 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  60.95 
 
 		 106 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  61.11 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  62.38 
 
 		 107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  61.9 
 
 		 107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  59.26 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  62.38 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  62.38 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  57.41 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  62.38 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  59.26 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  59.22 
 
 		 104 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  58.33 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  61.39 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  62.38 
 
 		 106 aa  136  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  61.39 
 
 		 106 aa  135  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  58.33 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  60.4 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  61 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  57.28 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  60.4 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  56.19 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  60.4 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  59.05 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  56.48 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  60.4 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  60.4 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  59.41 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  60.4 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  60.19 
 
 		 109 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  133  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  60.4 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  60.4 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  60.61 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  55.56 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  56.86 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  53.7 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  58.33 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  53.7 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  57.14 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  58.1 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  59.22 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  56.6 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  58.82 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  56.48 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  54.37 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  59.41 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  55.34 
 
 		 111 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  59.41 
 
 		 108 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  54.63 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  57.43 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  53.7 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  56.31 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  56.31 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  56.44 
 
 		 109 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>