More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0171 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  100 
 
 		 105 aa  216  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  75.24 
 
 		 106 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  80 
 
 		 104 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  77.14 
 
 		 104 aa  177  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  73.33 
 
 		 105 aa  174  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  73.33 
 
 		 104 aa  173  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  75.24 
 
 		 104 aa  173  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  73.33 
 
 		 104 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  73.33 
 
 		 104 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  75.24 
 
 		 104 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  59.81 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  57.55 
 
 		 109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  58.49 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  59.18 
 
 		 105 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  60.19 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  55.24 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  58.25 
 
 		 114 aa  127  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  57.28 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  54.72 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  52.38 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  53.4 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  49.51 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  55.88 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  50 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  51.92 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  53.77 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  53.47 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  58.33 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  50 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  52.48 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  50.48 
 
 		 109 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  48.6 
 
 		 113 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  50.53 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.57 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  48.6 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  54.76 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  48.54 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  55.21 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  55.95 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  47.57 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  50.5 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  50.5 
 
 		 104 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  54.84 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  46.73 
 
 		 107 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  47.57 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  49.5 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  55.95 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  46.67 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  50 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  57.14 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  54.17 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  45.71 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  54.76 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  55.91 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  48.04 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  50.48 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  44.66 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  51.49 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  48.54 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  46.6 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  46.6 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  45.63 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  50 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.51 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  50.52 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  50.52 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  50.52 
 
 		 108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  59.76 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  49.49 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  49.52 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  49.5 
 
 		 107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  48.54 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  51.69 
 
 		 109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  48.51 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  54.65 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  52.75 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  47.62 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  54.76 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  54.65 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  46.88 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>