More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0093 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  68.87 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  68.27 
 
 		 114 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  68.27 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  63.55 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  62.26 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  59.43 
 
 		 109 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  61.32 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  59.43 
 
 		 109 aa  144  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  58.49 
 
 		 109 aa  141  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  59.43 
 
 		 109 aa  140  7e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  60.19 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  55.77 
 
 		 105 aa  136  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  57.28 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  58.82 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  52.88 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  55.24 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  51.43 
 
 		 259 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  57.28 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55.34 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  51.4 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  57 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  57 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  60.19 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  54.29 
 
 		 108 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  53.27 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  54.46 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  53.85 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  51.4 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  56.6 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  54.9 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  52.34 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  56.31 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  56.44 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  56.19 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  52.94 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  53.33 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  55.34 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  49.51 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  54.21 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  53.92 
 
 		 106 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  54.9 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  54.9 
 
 		 110 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  56.12 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  55.45 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  56.31 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  52.94 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  54 
 
 		 107 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  52.43 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  52.53 
 
 		 259 aa  123  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  52.94 
 
 		 108 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  49.52 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  54.9 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.96 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  53.33 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  52.43 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  52.94 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  47.66 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  51.46 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  55.56 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  54.46 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  59.8 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>